Spoločnosť CHKBiotech úspešne vyvinula detekčnú súpravu pre nové varianty koronavírusu

Nový kmeň vírusu koronavírusu 501Y-V2 z Južnej Afriky
18. decembra 2020 zistila Južná Afrika mutanta 501Y-V2 nového koronavírusu. Teraz sa juhoafrický mutant rozšíril do viac ako 20 krajín. Pokusy ukázali, že mutanty nového vírusu Corona môžu niesť ďalšie varianty nového koronavírusu s mutáciami K417N / T, E484K a N501Y, ktoré môžu znižovať neutralizačnú schopnosť vakcínami indukovaných plazmatických neutralizujúcich protilátok. Avšak v porovnaní s referenčným genómom Wuh01 (poradové číslo MN908947) má 501Y.V2 juhoafrickej mutantnej genómovej sekvencie 23 nukleotidových variantov. Má rovnakú mutáciu N501Y ako britský podtyp B.1.1.7, ale stále obsahuje mutácie na dvoch kľúčových miestach E484K a K417N S proteínu, ktoré majú potenciálne dôležité účinky na schopnosť vírusu infikovať.

Nový koronavírus je jednovláknový RNA vírus, ktorého mutácie v genóme sú častejšie. Detekcia jedného cieľa môže ľahko viesť k zmeškanej detekcii vzoriek s nízkou vírusovou záťažou a mutovanými vírusovými kmeňmi. Miera opätovného vyšetrenia u jediného pozitívneho v detekcii cieľa môže dosiahnuť viac ako 10%, čo môže zvýšiť pracovné zaťaženie a predĺžiť čas diagnostiky. Detekcia viacerých cieľov a vzájomné overovanie výsledkov každého cieľa môžu zvýšiť mieru detekcie a uľahčiť včasnú diagnostiku.

news1

Obrázok 1. Schematický diagram mechanizmu infekcie novým koronavírusom

Nový mutant koronavírusu B.1.1.7 v Británii
26. decembra 2020 bola online publikovaná prvá vedecká práca z kmeňa B.1.1.7. The Institute of Hygiene University of London UK and Tropical Diseases, potvrdil, že kmeň B.1.1.7 sa šíri viac ako iné kmene, čo bolo viac ako 56% (95% CI 50-74%). Pretože tento nový mutantný kmeň má zjavnejšiu prenosovú silu, je čoraz ťažšie ovládať COVID-19. Nasledujúci deň University of Birmingham vo Veľkej Británii nahrala článok o MedRxive. Štúdia zistila, že počet kópií génov vírusu ORF1ab a N u pacientov infikovaných mutantným kmeňom B.1.1.7 (vypadnutie S-génu) sa významne zvýšil; tento jav bol sledovaný v populácii. Tento článok poukazuje na to, že pacienti infikovaní mutantom B.1.1.7 v Británii majú výrazne vyššiu vírusovú záťaž, takže tento mutant môže byť tiež patogénnejší.

1

Obrázok 2. Sekvencia mutácie genómu obsiahnutá v mutantnom kmeni koronavírusu B.1.1.7 v Británii

2

Obrázok 3. Mutácia N501Y sa vyskytla v Británii aj v Juhoafrickej republike Varianty

Detekčná súprava nových variantov koronavírusu
Spoločnosť Chuangkun Biotech Inc. úspešne vyvinula detekčnú súpravu pre nové varianty koronavírusu B.1.1.7 a 501Y-V2.

Výhody tohto produktu: vysoká citlivosť - súčasná detekcia 4 cieľov, pokrývajúca hlavné miesta mutácie mutantného kmeňa B.1.1.7 a juhoafrického mutantného kmeňa 501Y.V2. Táto súprava môže súčasne detegovať miesta mutácie N501Y, HV69-70del, E484K a nový gén S pre koronavírus; Rýchly test: výsledok trvá iba 1 hodinu a 30 minút od odberu vzorky.

3

Obrázok 4. Detekcia krivky zosilnenia variantov COVID-19 Britain

4

Obrázok 5. Detekcia krivky zosilnenia juhoafrických variantov COVID-19

5

Obrázok 6. Divoký typ novej amplifikačnej krivky nového koronavírusu

Nie je jasné, ako tieto mutácie akumulujú nový dlhodobý dopad práva na pandémiu COVID-19. Toto nám ale pripomína, že tieto mutácie môžu mať vplyv na účinnosť prirodzenej imunity a imunity vyvolanej očkovaním. Tiež nám pripomína, že musíme dlho nepretržite monitorovať nový koronavírus a aktualizovať vakcínu COVID-19, aby sme sa vyrovnali s vývojom nového koronavírusu.


Čas zverejnenia: 12. 12. 2021