CHKBiotech úspešne vyvinul detekčnú súpravu pre nové varianty koronavírusu

Nový kmeň variantu koronavírusu 501Y-V2 z Južnej Afriky
18. decembra 2020 Južná Afrika detekovala mutant 501Y-V2 nového koronavírusu.Teraz sa juhoafrický mutant rozšíril do viac ako 20 krajín.Experimenty ukázali, že vyššie uvedené mutanty nového koronavírusu môžu niesť ďalšie varianty nového koronavírusu mutácií K417N/T, E484K a N501Y, ktoré môžu znížiť neutralizačnú schopnosť vakcínou indukovaných plazmatických neutralizačných protilátok.Avšak v porovnaní s referenčným genómom Wuh01 (číslo sekvencie MN908947) má sekvencia 501Y.V2 mutantného genómu Južnej Afriky 23 nukleotidových variantov.Má rovnakú mutáciu N501Y ako britský mutantný podtyp B.1.1.7, ale stále obsahuje mutácie na dvoch kľúčových miestach E484K a K417N proteínu S, ktoré majú potenciálne dôležité účinky na schopnosť vírusu infikovať.

Nový koronavírus je jednovláknový RNA vírus, ktorého genómové mutácie sú častejšie.Detekcia s jedným cieľom môže ľahko viesť k zmeškanej detekcii vzoriek s nízkou vírusovou záťažou a mutovaných vírusových kmeňov.Miera opätovného vyšetrenia pri jednom pozitívnom náleze v cieľovej detekcii môže dosiahnuť viac ako 10 %, čo môže zvýšiť pracovné zaťaženie a predĺžiť čas diagnózy.Detekcia viacerých cieľov a vzájomné overovanie výsledkov každého cieľa môže zvýšiť mieru detekcie a uľahčiť včasnú diagnostiku.

novinky1

Obrázok 1. Schematický diagram mechanizmu infekcie novým koronavírusom

Nový mutant koronavírusu B.1.1.7 z Británie
Dňa 26. decembra 2020 bola online publikovaná prvá vedecká práca o kmeni B.1.1.7.Inštitút Hygiene University of London UK and Tropical Diseases potvrdil, že kmeň B.1.1.7 je schopnejší šírenia ako iné kmene, čo bolo viac ako 56 % (95 % CI 50-74 %).Pretože tento nový mutantný kmeň má zreteľnejšiu prenosovú silu, je ťažšie kontrolovať COVID-19.Nasledujúci deň University of Birmingham v Spojenom kráľovstve zverejnila článok na MedRxiv.Štúdia zistila, že počet kópií génu ORF1ab a vírusu N u pacientov infikovaných mutantným kmeňom B.1.1.7 (vypadnutie S-génu) sa významne zvýšil;tento jav bol sledovaný v populácii.Tento článok poukazuje na to, že pacienti infikovaní mutantom B.1.1.7 z Británie majú výrazne vyššiu vírusovú záťaž, takže tento mutant môže byť aj patogénnejší.

1

Obrázok 2. Sekvencia mutácie genómu obsiahnutá v koronavírusovom mutantnom kmeni B.1.1.7 z Británie

2

Obrázok 3. Mutácia N501Y sa vyskytla v Británii aj v Južnej AfrikeVarianty

Detekčná súprava nových variantov koronavírusu
Spoločnosť Chuangkun Biotech Inc. úspešne vyvinula detekčnú súpravu pre nové varianty koronavírusu B.1.1.7 a 501Y-V2.

Výhody tohto produktu: vysoká citlivosť,súčasná detekcia 4 cieľov, pokrývajúcich hlavné mutačné miesta mutantného kmeňa B.1.1.7 a 501Y.V2 juhoafrický mutantný kmeň.Táto súprava dokáže simultánne detegovať miesta mutácie N501Y, HV69-70del, E484K a nový gén koronavírusu S;Rýchly test: od odberu vzorky po výsledok trvá iba 1 hodina 30 minút.

3

Obrázok 4. Detekcia amplifikačnej krivky variantu COVID-19 v Británii

4

Obrázok 5. Detekcia krivky amplifikácie variantu COVID-19 v Južnej Afrike

5

Obrázok 6. Krivka amplifikácie nového koronavírusu divokého typu

Nie je jasné, ako tieto mutácie akumulujú nový dlhodobý vplyv pandémie COVID-19.To nám však pripomína, že tieto mutácie môžu ovplyvniť účinnosť prirodzenej imunity a imunity vyvolanej očkovaním.Tiež nám to pripomína, že musíme nový koronavírus dlhodobo monitorovať a aktualizovať vakcínu COVID-19, aby sme sa vyrovnali s vývojom nového koronavírusu.


Čas odoslania: 12. marca 2021